La région de Montagne Saint-Émilion bénéficie d'un climat océanique pondéré de touches méditerranéennes, comme en témoigne la présence de figuiers et de chênes verts. Montagne Saint-Emilion fait partie des appellations les plus à l'Est du vignoble bordelais, ce qui lui apporte des nuances continentales. Le vignoble s'inscrit dans le prolongement géographique de ceux de Pomerol et de Saint-Émilion. Les sols y sont généralement argilo-calcaires ou limono-argileux sur le plateau et les coteaux, avec une touche de sablo-argileux à l'ouest du territoire.